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北京大学第三医院秦皇岛医院是以北京大学第三医院为输出医院、原秦皇岛军工医院为依托医院组建的一所集医疗、教学、科研、康养和保健为一体的综合性公立医院。医院前身为中国人民解放军总后勤部第六职工医院，1993年医院整体搬迁至秦皇岛市，更名为“秦皇岛军工医院”。2021年6月11日，获批第二批国家区域医疗中心试点项目。2023年1月5日，医院正式揭牌更名为“北京大学第三医院秦皇岛医院”。
医院拥有2个院区，原军工院区与开发区院区（筹建中），目前实行过渡期管理，在原军工院区运营。军工院区总占地30亩，建筑面积3.09万平方米，其中医疗建筑2.78万平方米，实际开设床位708张，现有在岗职工944人，正高级职称39人，副高级职称160人。医院设有44个临床医技科室，其中包括国家中医药管理局“十二五”重点专科1个（康复医学科），市级临床重点专科4个(心血管内科、重症医学科、急诊科、麻醉科），市级医学重点学科6个(心血管内科、重症医学科、急诊科、麻醉科、泌尿外科、内分泌科），市级中医药重点学科2个（中医康复学、中医痹病学）。目前拥有核磁共振机2台（3.0T和1.5T）、CT机4台、GE数字减影血管造影系统2台、EMS混合动力碎石清石系统、大功率激光手术系统、4K腹腔镜系统、4K超高清内窥镜摄像（关节镜）系统等先进医疗设备。
医院新院区位于秦皇岛市经济技术开发区，2020年7月开工建设，项目总投资28.3亿元，占地300亩，规划床位1200张，建筑面积25.25万平方米，由医疗综合楼、健康管理中心楼、美容生殖康复楼、感染疾病科楼、行政科研楼、专家公寓、会议中心、餐厅、动力中心等9栋楼宇组成。医院建设结合医疗建筑特点需求、基地特征，采用了“一带两园三区”的规划，是全省最大的装配式钢结构单体公共建筑工程。目前，主体结构已基本完成，开始进入室内外装修、机电安装、医疗专业工程及设备安装阶段，信息化系统、后勤配套的招标采购逐步实施，计划2025年6月投入使用。
自揭牌成立以来，北医三院秦皇岛医院在秦皇岛市委、市政府坚强领导下，在输出医院北医三院大力支持帮助下，紧紧围绕建设国家区域医疗中心，坚持以人民健康为己任，以“团结、奉献、求实、创新”为院训，秉承“大专科、小综合”的办院模式，积极推进与北医三院的对接融入，狠抓医疗质量和服务能力提升，学科建设、专家引入、学术交流、人才培养取得明显成效， 打造了心血管、康复医学、运动医学、骨科等品牌学科，医疗水平和急危重症救治能力得到实质性进步,推出了核磁二十四小时全天候服务等六大便民举措，患者满意度持续增强，异地就医患者逐年增加，受到市委、市政府主要领导和广大患者充分肯定和一致好评。医院先后荣获荣获“全国敬老”文明号、河北省医疗保障工作先进集体、秦皇岛市爱国拥军模范单位、秦皇岛市巾帼建功先进集体、市直机关先进基层党组织、秦皇岛市五四红旗团委等荣誉称号，并被授予河北省工伤康复试点机构、秦皇岛市体育局运动医疗服务保障定点医院。
雄关漫道真如铁，而今迈步从头越。北医三院秦皇岛医院将以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，认真贯彻落实党的二十大和二十届三中全会精神，紧紧围绕建设国家区域医疗中心，坚持以人民健康为己任，统一思想、坚定信心，抢抓机遇、攻坚克难，不忘医者初心，牢记肩负使命，为进一步推动医院快速发展、早日建成国家区域医疗中心而团结奋斗！
院训：
团结、奉献、求实、创新
